21. mars 1997 ble det avholdt stiftelsesmøte i Stiftelsen Risør Akvarium. Protokollen ble undertegnet av oppretter ved ordfører Lars Lauvhjell på vegne av Risør kommune.
§ 2 i særutskrift av vedtekter: Risør Akvarium er en selveiende institusjon som er opprettet av Risør kommune og har som formål å ivareta og drive sjøakvarium med publikumsbesøk, informasjonsvirksomhet til skoler og institusjoner samt kunne være feltbase i marinbiologisk forskervirksomhet
Festekontrakten til bygningen gir Stiftelsen Risør Akvarium bruksrett til bygget, og er uoppsigelig. Grunnkapitalen var på kr. 2.200.000.- som representerte bygningen i Strandgaten 14, i dette beløpet var kr. 1.000.000.-, en gave til Risør kommune fra Thomas Thiis-Evensen.
Billettinntekter er hovedinntekten til Risør Akvarium. Kommunalt driftstilskudd er også blitt innvilget, og har de siste årene vært et fast tilskudd. I tillegg har både DNB ved Sparebankstiftelsen og Sparebanken Sør gitt støtte i årenes løp. Dette er midler som i sin helhet har gått til utbygging og kvalitetshevelse av Risør Akvarium. Også andre har bistått og bistår med dugnad, gaver og bistand på ulike hold.
Styret består av:
Ansatte:
Risør Akvarium vil rette en spesiell takk til Risør Fiskemottak, Havforskningsinstituttet Flødevigen, Risør Undervannsklubb, Vivara Norge, yrkesfiskere, hobbyfiskere og alle privatpersoner som tilfører Risør Akvarium både gjenstander og fisk og havdyr til utstillingen.